醫院設置165個臨床、醫技科室，233個護理單元，擁有8個國家重點學科、1個國家重點實驗室、20個省部級及全軍重點實驗室、33個全軍醫學專科中心和研究所，形成了以綜合診療為特色的13項專業優勢。同時是全軍重癥監護示范基地和中華護理學會的培訓基地。設有國際醫學中心和健康醫學中心，提供高端預防保健服務。醫院年門急診量490余萬人，收容19.8萬人，手術近9萬例。
中國人民解放軍總醫院前身是中國協和醫學院第二臨床學院，1953年10月，總后方勤務部衛生部決定將“中國協和醫學院第二臨床學院”改為“軍委直屬機關醫院”。
繳費須知
北京醫保區
選擇該院為定點醫院的北京市醫保人員。
使用就醫本人工行、農行、中行、建行任意一張銀行卡預約掛號。
持掛號時使用的銀行卡在自助機上自助繳費。
持社保卡到綜合窗口打印發票。
他卡通區
無就醫本人工行、農行、中行、建行銀行卡。
費別為“全費”“地方公療”和“新農合”的人員。
持就醫本人二代身份證，使用本人四大銀行卡以外任意銀行卡（可用他人銀行卡）預約掛號。
持掛號時使用的銀行卡在自助機上自助繳費。